提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
江苏睢宁“胜景图”：筑巢引凤迎新春 能人返乡谋振兴******
(新春走基层)江苏睢宁“胜景图”：筑巢引凤迎新春 能人返乡谋振兴
中新网徐州1月18日电 题：江苏睢宁“胜景图”：筑巢引凤迎新春 能人返乡谋振兴
作者 朱志庚 顾士刚
1月17日，在江苏省睢宁县庆安镇林庄村，通透的蓝天，暖暖的冬阳，一栋栋新建高标准厂房拔地而起，一个个大红灯笼高高挂在枝头，一群群村民挥舞着铁锹平整园区场地，“奏响”了一曲曲乡村振兴的迎春“新乐章”。
“大家再加把劲干呀，今天还有几位回乡过年的能人来看看我们的新厂房，准备把企业搬到林庄村来。我们筑好巢，一定能引来金凤凰的……”正在干活的林庄村党总支书记赵飞大声给一起劳动的村民加油鼓劲。2022年，在老村部和废弃学校的旧址上，林庄村投资200多万元新建了3000平方米的高标准厂房。
林庄村在外创业成功人士较多，亿元以上产业者有3人，千万元以上产业者有30多人，百万元以上产业者有100多人。林庄村利用这一优势资源，激发在外创业成功人士为家乡投资的热情，开辟出村集体经济发展新路径。每年春节前，村里都会召开“林庄村商务座谈”。返乡的能人和村民们共话家乡变化，谋划家乡发展，绘画家乡风景，勾勒林庄村宜居宜业和美的“胜景图”。
宋之高投资5000多万元在林庄村成立睢宁福昌泰电子科技有限公司，拥有3个厂房共计3500平方米，年产值2000多万元，带动60多人就业。投资5000万元的徐州犇驰生态牧业有限公司坐落在林庄村龙姚路西侧，年出栏肉牛1200头，年产值2000多万元。
广东省佛山市顺德区科贝隆塑料机械有限公司董事长高聪华是林庄村人。他现在和庆安镇政府、林庄村委会已经达成投资协议。说到给家乡到底捐了多少钱，他笑说：“具体不记得了，光是2020年疫情防控期间就捐款20万元了。”
村民们平整新建厂房门前地面。 顾士刚 摄林庄村经过村民代表大会、党员代表大会、村两委班子成员多次开会讨论后，报请庆安镇党委政府同意，决定打造林庄村能人返乡创业工业园。因村部和原来废弃学校连在一起，所以林庄村就规划把村部搬迁出去。这样集中资源在村部和废弃学校的旧址上建两个高标准厂房，与宋之高的三个厂房连成片、构成线，倾力“筑好巢”，只为“引凤来”。
2021年，高聪华捐资12万元为村里购置了一条口罩生产线，然而由于没有厂房，导致机器一直存放在村部。现在虽然有了高标准厂房，也成功注册了负责生产运营的实体公司，但是村民对集体投资几万元购买原料顾虑重重。于是，赵飞在2023年新年打算自己先拿3万元购买生产原料。“如果公司盈利了，算村集体的；如果亏损了，算自己的。”他坚信在如今这么好的市场环境下，集体经济发展会成功的。
“我们要把招商兴业作为全面乡村振兴的首要任务来抓，敢为、敢闯、敢干、敢首创。”庆安镇镇长周扬说，庆安镇聚焦塑料制品、汽车电子、绿色建材三大主导产业实施产业链招商，发挥区位、资源等优势开展“以商招商”。目前，庆安镇累计签约重大项目33个。项目当年落地转化率位居全县第一。(完)
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